1.患者有肺部和呼吸道症状如慢性咳嗽或在慢性咳嗽基础上咳嗽加重，咯血或痰中带血以及哮喘或喘鸣等，为了查明其原因及病变部位。

2.影像学资料显示肺部异常阴影如肺内炎症改变、肺不张、肺门增大和肺门或肺内块影等，为发现病变和确定病变性质。

3.术前检查及定位某些气管、支气管肿瘤或中心型肺癌，为了明确病变位置，以判定能否手术切除和切除范围。

4.痰脱落细胞查到癌细胞，而胸部影像学资料阴性为了寻找病灶进一步明确诊断，或通过激光血卟啉的方法，早期发现肺癌。

5.放疗、化疗及手术后的疗效观察检查有无复发，肉芽增生或狭窄等。

6.经气管、支气管针吸活检可对支气管镜不能到达的肺内病灶或隆嵴下及肺门处的病灶进行镜下针吸活检。

7.声带检查原因不明的声带麻痹。

8.食管癌上段或中段食管癌是否侵犯气管、支气管。

9.胸部手术后分泌物潴留所致的肺不张通过床旁支气管镜及时抽吸可使肺复张。

10.摘取支气管阻塞病变如小的良性肿瘤、肉芽组织。

11.支气管胸膜瘘通过支气管镜检查发现瘘口并向瘘口处注入黏堵剂如纤维蛋白胶。

12.气管内治疗气管支气管内的激光治疗或近距离放射治疗。

13.协助气管内插管和气管插管的定位尤其是双腔管插管。

14.支气管肺泡灌洗可用于肺癌、间质性肺疾病或免疫缺陷病的诊断，还可用于肺炎、哮喘、慢性支气管炎或肺化脓症的治疗。