新生儿吞咽能力差可能是吞咽功能下降、先天发育异常、扁桃体发炎等原因导致，日常生活中需要注意观察新生儿变化。

1、吞咽功能下降

如果是早产或体重较轻的新生儿，可能因为长期胃管喂养导致吞咽功能没有锻炼，出现吞咽困难。

2、先天发育异常

如果新生儿有先天性肺发育障碍或其他疾病，会导致吞咽受到影响，出现吞咽功能差。

3、扁桃体发炎

如果新生儿扁桃体发炎会导致声音沙哑和吞咽功能差。

除上述常见原因外，还可能是脑损伤造成，具体原因需要到正规医院进行检查，根据病因进行针对性治疗。