阴茎皮上长小水疱可能是不注意个人卫生、细菌感染、病毒感染等因素所引起，要根据原因进行治疗。

1.不注意个人卫生

可能是没有做好个人卫生所引起，应该及时加强个人卫生，要减少受到刺激。

2.细菌感染

可能是阴茎受到了细菌感染所引起，可以在医生指导下使用红霉素软膏、莫匹罗森软膏、金霉素软膏等药物。

3.病毒感染

也有可能是受到了病毒感染所引起，可以在医生指导下使用阿昔洛韦乳膏、伐昔洛韦软膏、利巴韦林片等。

除此之外也可能是珍珠疹等因素导致，需要到医院检查治疗。