13岁一蹲下膝盖就疼可能与生长痛、急性外伤、半月板损伤等情况有关，需要结合病因采取治疗措施。

1、生长痛

如果活动力量较大或者生长过快，与局部肌肉和肌腱的生长发育不协调，就有可能会引发生理性疼痛，可以通过减少剧烈运动、补充营养、局部热敷、按摩等方式进行改善。

2、急性外伤

如果膝盖部会受到外地撞击，导致软组织损伤，也会引发疼痛，并且出现肿胀、淤青等现象，可以通过冷、热敷的方式进行缓解。

3、半月板损伤

如果13岁的时候经常爬楼梯或者剧烈运动，导致膝关节过度负重，造成半月板损伤，也会引发下蹲疼痛，可以遵医嘱使用布洛芬颗粒、硫酸氨基葡萄糖胶囊、硫酸软骨素片等药物进行治疗，起到消炎止痛、营养软骨的作用。

除此之外，还可能是类风湿性关节炎等疾病的可能性，需要到医院查明病因后选择合适的治疗方法。