一般情况下，三个月的孩子不吃夜奶是不会出现危害的，但三个月的孩子长时间不吃夜奶，很可能会出现低血糖或影响到身体的生长发育，对身体的健康造成不利。

对于三个月的孩子，通常需要三个小时左右喂奶一次，能够满足身体所需要的物质，促进身体的正常发育，如果孩子长时间处于睡眠的状态，6个小时到8个小时仍然没有食用，很可能会导致身体的热量消耗过多，出现低血糖情况的发生。同时如果不能够及时补充身体所需要的营养物质，还可能会出现营养不良，影响到身体的正常发育。

三个月孩子不吃夜奶，如果伴有腹胀腹泻等情况，需要及时到医院进行相关检查，明确诊断后采取合理的方式进行治疗，能够避免情况加重。